kernel_logrank_python_code:内核Logrank测试和OptHsic测试的Python代码

时间:2024-03-12 18:48:04
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文件名称:kernel_logrank_python_code:内核Logrank测试和OptHsic测试的Python代码

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更新时间:2024-03-12 18:48:04

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内核Logrank和OptHsic 介绍 该存储库包含用于两种方法的python代码,以测试右检查的生存时间T(由检查时间C进行检查)与协变量X(任意维度的随机向量)之间的独立性。 方法是内核对数秩检验(1)和OptHsic(2)。 有关方法,请参见 (1)右删失数据的内核对数秩检验/ Tamara Fernandez,Arthur Gretton,David Rindt,Dino Sejdinovic。 ( )。 (2)使用最优传输的右删失数据的非参数独立性测试David Rindt,Dino Sejdinovic,David Steinsaltz。 ( ) 内容 wild_bootstrap_LR.py包含(1)的内核日志等级测试,该测试使用通配引导程序来拒绝或接受空假设。 opthsic.py包含(2)的验光测试。 FisherInformation计算Fisher信息矩阵


【文件预览】:
kernel_logrank_python_code-master
----data()
--------metabric_IHC4_clinical_train_test.h5(88KB)
--------kidney.csv(2KB)
--------aml(575B)
--------gbsg.csv(26KB)
--------download_data.R(743B)
--------melanoma(13KB)
--------leukemia(575B)
--------download_from_rdatasets.py(711B)
--------harvard_course.R(3KB)
--------.Rhistory(16KB)
--------gastric.csv(2KB)
--------loan_data(98KB)
--------support_train_test.h5(561KB)
--------diabetic.csv(16KB)
----experiments()
--------real_data()
--------simulated_data()
----pickles()
--------.DS_Store(20KB)
----examples.py(2KB)
----utils()
--------FisherInformation.py(2KB)
--------survival_scatter_plot.py(2KB)
--------__pycache__()
--------get_kernel_matrix.py(3KB)
----README.md(2KB)
----.idea()
--------.gitignore(176B)
--------misc.xml(185B)
--------vcs.xml(180B)
--------inspectionProfiles()
--------kernel_logrank_python_code.iml(441B)
--------modules.xml(304B)
----tests()
--------opthsic.py(4KB)
--------wild_bootstrap_LR.py(4KB)
--------CPH_test.py(649B)
--------__pycache__()
----__pycache__()
--------new_wild_bootstrap_LR.cpython-37.pyc(3KB)
--------wild_bootstrap_LR_2.cpython-37.pyc(3KB)
--------CPH_test.cpython-36.pyc(938B)
--------FisherInformation.cpython-36.pyc(1KB)
--------FIS_LIN_LR_test.cpython-37.pyc(2KB)
--------FisherInformation.cpython-37.pyc(1KB)
--------LIN_LR_test.cpython-37.pyc(2KB)
--------wild_bootstrap_LR.cpython-37.pyc(3KB)
--------FIS_GAU_LR_test.cpython-37.pyc(2KB)
--------GAU_X_LR_test.cpython-37.pyc(2KB)
--------POL_LR_test.cpython-37.pyc(2KB)
--------wild_bootstrap_LR_1.cpython-37.pyc(3KB)
--------opthsic.cpython-37.pyc(2KB)
--------CPH_test.cpython-37.pyc(942B)
--------GAU_X_GAU_Z_LR_test.cpython-37.pyc(2KB)
--------wild_bootstrap_LR.cpython-36.pyc(3KB)

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