which_tree:系统发育推断方法的测试

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文件名称：which_tree:系统发育推断方法的测试
文件大小：1.35MB
文件格式：ZIP
更新时间：2021-05-18 23:32:50
R 系统发育重建方法的评价 该存储库包含用于运行本文中的仿真和树比较的代码： 模拟 模拟按以下步骤运行： 对带有alf-tree-testing-sim.drw参数的基因使用 。 所需的起始基因组和树都包含在此存储库中。 alfsim alf-tree-testing-sim.drw 将用于基因间区域，并带有参数文件intergenic.dawg ： dawg intergenic.dawg > intergenic_tree_test.mfa 然后将这些与以下命令组合： ./dawg_to_alf.pl speciesMapping.txt intergenic_coordinates.txt dawg_output.mfa ./alf_db_to_fasta_splice_intergenic.pl SE0xx_dna.fa dawg/MSA > SE0xx_genome.f