文件名称：Arpeggio:ChIP-seq实验的谐波分析-开源
文件大小：15.7MB
文件格式：JAR
更新时间：2024-06-16 11:25:40
开源软件
在探索性测序研究中生成新的全基因组数据的研究人员，可以通过将其数据与具有相似基因组模式的注释良好的数据集进行比较，从而获得生物学见解。 需要有效的数据压缩技术，才能将新的基因组实验与大型公共资料库进行有效比较。 琶音使我们能够有效地比较许多ChIP-seq数据集，这些数据集由从各种细胞，条件和生物体中收集的多种类型的DNA结合蛋白组成。 重要的是，这些相互作用模式广泛反映了结合事件的生物学特性。 为了生成称为琶音轮廓的这些轮廓，我们将谐波解卷积技术应用于ChIP-seq信号的自相关轮廓。 Wiki页面（http://sourceforge.net/p/arpeggio/wiki/Home/）中提供了详细的教程。