文件名称：modlAMP:Python软件包，用于肽序列生成，肽描述符计算和序列分析
文件大小：2.81MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-05-28 18:16:53
Python
自述文件 模组 这是一个Python软件包，设计用于处理肽，蛋白质或天然氨基酸的任何氨基酸序列。 它包含了几个模块，例如描述符计算（模块descriptors ）或序列生成（模块sequences ）。 有关如何使用该软件包的基本说明，请参阅本自述或部分。 安装 快速说明：从版本4开始，modlAMP支持Python3。不建议与Python 2.7一起使用。 为了使安装正常进行，需要安装pip 。 如果不确定是否已有pip，请在终端中键入pip --version 。 如果尚未安装pip，请通过sudo easy_install pip安装。 无需手动下载软件包即可安装modlAMP。 在您的终端中，只需键入以下命令： pip install modlamp 要将modlamp更新到最新版本，请运行以下命令： pip install --upgrade modlamp 用法 本节
【文件预览】：
modlAMP-master
----setup.py(1KB)
----.gitignore(117B)
----requirements.txt(188B)
----Makefile(142B)
----CHANGELOG(6KB)
----LICENSE.rst(2KB)
----bin()
--------example_modlamp.py(2KB)
--------mic_conversion.py(2KB)
--------example_modlamp.rst(7KB)
--------example_descriptors.py(2KB)
----.travis.yml(241B)
----MANIFEST.in(67B)
----TODO.rst(12B)
----modlamp()
--------plot.py(30KB)
--------wetlab.py(21KB)
--------data()
--------__init__.py(132B)
--------datasets.py(11KB)
--------database.py(5KB)
--------analysis.py(16KB)
--------descriptors.py(53KB)
--------sequences.py(33KB)
--------version.py(174B)
--------core.py(68KB)
--------ml.py(25KB)
----README.rst(12KB)
----tests()
--------test_database.py(648B)
--------test_peptide_descriptor.py(4KB)
--------__init__.py(39B)
--------test_plot.py(1KB)
--------test_core.py(2KB)
--------test_global_descriptor.py(3KB)
--------test_wetlab.py(1KB)
--------test_ml.py(2KB)
--------test_centrosymmetric.py(948B)
--------test_amphiarc.py(1020B)
--------test_kinked.py(418B)
--------test_ngrams.py(596B)
--------test_helix.py(844B)
--------test_oblique.py(580B)
--------test_datasets.py(2KB)
--------test_analysis.py(2KB)
--------files()
--------test_random_seq.py(539B)
--------test_hepahel.py(532B)
--------test_helicesACP.py(370B)
----docs()
--------examplescript.rst(39B)
--------Makefile(8KB)
--------index.rst(2KB)
--------conf.py(12KB)
--------layout.html(371B)
--------modlamp.rst(2KB)
--------google-analytics.html(415B)
--------static()
--------todo.rst(24B)
--------readme.rst(26B)
--------license.rst(27B)
--------theme.conf(727B)