文件名称：atacr:分析捕获序列计数数据
文件大小：17.2MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-06-02 19:18:54
science data bioinformatics r genomics
阿塔克尔 帮助分析来自RNA捕获序列和ATAC捕获序列实验的计数数据。 通过使用BioConductor RangedSummarizedExperiment对象，atacr实现了一组辅助功能和质量控制图，这些功能和功能控制图特定于跨基因组窗口中的读数计数分析。 特别是，atacr对于执行样本归一化以及在常见参考设计中轻松地进行差异可访问窗口的自举和贝叶斯因子测试非常有用。 安装 您可以使用以下命令从github安装atacr： # install.packages("devtools") devtools :: install_github( " TeamMacLean/atacr " ) 文献资料 您可以阅读以下主题的文档 差异视窗 子集数据 快速开始： library( atacr ) summary( sim_counts ) # > ATAC-seq experiment o