文件名称:ATACFlow:封装在NextFlow中的ATAC-seq管道,可由Jupyter运行
文件大小:371.4MB
文件格式:ZIP
更新时间:2024-02-24 01:37:56
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NCBI-Hackathons / ATACFlow 该管道使用Nextflow执行ATAC Seq 介绍 NCBI-Hackathons / ATACFlow:该管道使用Nextflow执行ATAC Seq 该管道是使用构建的, 是一种工作流工具,可以以非常便携的方式跨多个计算基础架构运行任务。 它带有docker / singularity容器,使安装变得轻而易举,并且结果可高度重现。 参考 您发现该管道对您的研究有用吗? 您可以使用DOI 10.17605 / OSF.IO / UCWRH( )引用它。 文献资料 NCBI-Hackathons / ATACFlow管道随附有关管道的docs/ ,可在docs/目录中找到: 管道配置 学分 该管道是由ATACFlow团队@ ( )编写的。 Ignacio Tripodi(colorado.edu上的ignacio.tripodi):计算机科学家,壁橱湿实验室爱好者 曾志伟(nih.gov的hsinyi.tsang):计算生物学家 赵晶晶(gmail.com的jjzhao123):生物信息学博士后学者 Evan Flode