文件名称：rna_seq
文件大小：2KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-04-06 03:45:14
Python
rna_seq 概述： 使用和进行比对的RNA-Seq管线（如果是后者则为伪比对）。 参数： -a | --aligner-to-use -a | --aligner-to-use ：如果要使用Kallisto，则指定1如果要使用HISAT2，则指定2 。 默认值：Kallisto -i | --input-files-directory -i | --input-files-directory ：输入包含FASTQ文件的目录的路径。 -r | --reference-index -r | --reference-index ：输入参考索引的路径。 1.如果选择了Kallisto，则输入索引参考转录组的路径（以.idx结尾）； 2.如果选择了HISAT2，则输入带前缀的索引参考基因组的路径-o | --output-directory -o | --output-directory ：
【文件预览】：
rna_seq-main
----aligner_wrapper.py(3KB)
----README.md(2KB)