文件名称：scDiffCom:来自scRNA-seq数据的细胞间通讯差异
文件大小：2.7MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-04-29 12:57:19
R
scDiffCom 概述 该软件包提供了分析工具，以研究scRNA-seq数据集中两个目标条件之间的细胞间通讯变化。 它依赖于精选的配体-受体相互作用（适用于人类和小鼠）的集合，这些相互作用已从八个公共数据库中检索和处理。 单击此处显示配体-受体来源-[CellChat]（ ）-[CellPhoneDB]（ ）-[CellTalkDB]（ ） - [connectomeDB2020]（ ） - [ICELLNET]（ ） - [NicheNet]（ ）-[SingleCellSignalR]（ ）-[scTensor]（ ） 使用应该包含应该以细胞类型和两个感兴趣的组（例如，年轻/年长）注释的细胞的对象作为输入，该程序包可以推断可能与生物学信号相对应的细胞-细胞相互作用，并在两种条件之间发生显着变化。 有关scDiffCom使用的统计方法的实现详细信息，请参阅我们的（准
【文件预览】：
scDiffCom-master
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----vignettes()
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--------testthat()
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