excord:从BAM提取SV信号

【文件属性】：

文件名称：excord:从BAM提取SV信号

文件大小：12KB

文件格式：ZIP

更新时间：2024-05-18 18:12:50

genomics structural-variation Go

雅阁 excord提取片段和成对末端的读数，这些读数可能是结构变异的指标。 它还输出参考深度。 excord的输出用作输入 用法 默认情况下，excord期望来自单个染色体的东西： excord --fasta $fasta --prefix some/cool/project $bam $chrom | bgzip -c > $out 这将写入some / cool / project.rp.bin，其中参考和对覆盖范围是交错的。 可以从stdin读取bam并只写discorant和splitter： | excord --discordantdistance 500 --fasta $fasta /dev/stdin | bgzip -c > $out 用这种模式不可能写参考范围。 阿克 excord是公司base2基因组学的一部分。

【文件预览】：
excord-master
----LICENSE(11KB)
----README.md(792B)
----cmd()
--------excord()