文件名称：Laurel-genes
文件大小：4.8MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-05-25 05:23:14
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生物信息学2021课堂项目 月桂树中殿力量 数据 该项目中使用的数据是来自Calder Atta的比目鱼外显子捕获数据的原始读取。 我使用的是两种：沙棘（Hippoglossoides Platesides）和Microstomus pacificus。 该项目的最终目标是能够查看这些样本的SNP变体。 第1步-解压缩 我从原始数据文件夹../data/raw原始数据../data/raw 。 这些是外显子捕获的压缩fastq文件，每个物种一个文件用于正向（R1），一个文件用于反向（R2）。 要查看它们，需要将它们解压缩（请参阅01_unzip.ipynb）。 对于这些样本，我不需要合并泳道，因为它们只运行一次。 第2步-修剪 下一步是修整适配器和低质量的基座（请参见02_trim.ipynb）。 此步骤是从Calder Atta（ ）修改而来的。 要使用perl脚本trim_adapt
【文件预览】：
Laurel-genes-main
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----.DS_Store(6KB)
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--------.DS_Store(6KB)
--------546_R_HW()
----.ipynb_checkpoints()
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--------multiqc-checkpoint.ipynb(72B)
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----README.md(4KB)
----scripts()
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