文件名称：variant2literature
文件大小：2.23MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-06-06 17:41:12
genomics Python
variant2literature（v2l） 从xml，pdf，doc，docx，xlsx，csv格式的学术论文中提取和标准化变体。 所需数据和包装 CRF ++： 下载 将CRF ++。0.58.tar.gz放入variant2literature/ 下载以下文件，并将它们放在variant2literature/models/ FasterRCNN模型： UCSC表（hg19）： NCBI基因_信息 https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/gene/DATA/gene2refseq.gz ucsc.hg19.fasta 从ucsc下载并将其转换为fasta格式，或者从GATK捆绑下载并解压缩。 将其重命名为ucsc.hg19.fasta （如果文件名不是ucsc.hg19.fasta ）。 tmVar 下载tmVar 2.0 将tmVarJ