文件名称：multitfa：Python中基于多元热力学的代谢通量分析
文件大小：8.96MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-02-29 02:26:37
python3 thermodynamics multivariate metabolism tfa
多TFA 我们介绍了multiTFA，这是一个基于多变量热力学的Python代谢通量分析软件包。 该框架利用了React的吉布斯*能协方差矩阵，利用热力学约束条件严格限制了代谢模型。 它代表了对描述的以前的热力学代谢通量分析（tMFA）方法的改进。 此实现需要使用COBRA模型作为输入，以及其他隔室条件和代谢物浓度。 它允许用户在COBRA模型上执行各种热力学分析，例如热力学代谢通量分析，变异性分析或通量采样。 请参阅下面的更多详细信息。 安装 从PyPI安装multitfa很简单：（我们建议使用）。 pip install multitfa 要从源代码安装， git clone https://github.com/biosustain/multitfa.git cd multitfa pip install . 我们强烈建议安装 。 尽管我们支持求解器，但我们注意到它在
【文件预览】：
multitfa-main
----MANIFEST.in(238B)
----README.rst(4KB)
----pyproject.toml(181B)
----docs()
--------make.bat(799B)
--------requirements.txt(56B)
--------Makefile(638B)
--------source()
----.github()
--------PULL_REQUEST_TEMPLATE.md(143B)
--------SUPPORT.rst(92B)
--------ISSUE_TEMPLATE()
--------CONTRIBUTING.rst(3KB)
--------workflows()
--------CODE_OF_CONDUCT.md(5KB)
----tests()
--------test_integration()
--------test_unit()
----tox.ini(2KB)
----LICENSE(10KB)
----src()
--------multitfa()
----setup.cfg(2KB)
----examples()
--------paper_data_example.py(2KB)
----setup.py(841B)
----.gitignore(13KB)
----Makefile(2KB)
----CHANGELOG.rst(433B)
----.editorconfig(327B)
----.gitattributes(38B)