【文件属性】：
文件名称：matlabauc代码-LPI_FKLKRR:基于快速内核学习的内核岭回归识别LPI
文件大小：104.32MB
文件格式：ZIP
更新时间：2021-05-24 10:08:14
系统开源
Matlab的耳语基于快速核学习识别LncRNA-蛋白质与核岭回归的相互作用
关于
我们通过使用内核岭回归与多核学习方法，开发了一种新的lncRNAs-蛋白质相互作用（LPIs）预测方法。
输出包含五个文件，分别名为bench_auc.fig，bench_loo_pr，bench_loo_roc.fig，bench_pr.fig和result.mat。
通常，我们的方法可以使用高性能计算机在几秒钟内处理LPI的预测。
输入：lncRNA的相似性，包括K_GIP，K_SW，K_SF，K_EXP；
蛋白质的相似性，包括K_GIP，K_SW，K_SF，K_GO
相似矩阵构造：
高斯相似度矩阵是由kernel_gip.m构建的，
kernel_lncRNA_feature_CT，SW_lncRNA_Similarity，kernel_lncRNA_feature_expression，
input_info.mat中的kernel_protein_feature_PsePSSM，SW_Protein_Similarity，protein_GO_Jacard是预先计算的相似性矩阵。
lncRNA
【文件预览】：
LPI_FKLKRR-master
----LPI_FKLKRR.part3.rar(22.89MB)
----README.md(3KB)
----LPI_FKLKRR.part1.rar(22.89MB)
----LPI_FKLKRR.part4.rar(22.89MB)
----LPI_FKLKRR.part5.rar(12.87MB)
----LPI_FKLKRR.part2.rar(22.89MB)