文件名称：主成分回归代码matlab及例子-scTenifoldNet:这是CRANR软件包系统信息库的只读镜像。scTenifoldNet—从单细胞转
文件大小：53KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-06-15 06:41:55
系统开源
主成分回归代码matlab及示例scTenifoldNet AR / MATLAB程序包使用基于机器学习方法从不同条件收集的单细胞RNA-seq（scRNA-seq）数据来构建和比较单细胞基因调控网络（scGRN）。 scTenifoldNet使用主成分回归，张量分解和流形比对来准确识别甚至微妙转移的基因表达程序。 安装： scTenifoldNet可通过CRAN存储库获得，您可以使用以下命令安装scTenifoldNet ： install.packages('scTenifoldNet') library(scTenifoldNet) 或者，如果您对开发中的版本感兴趣，则可以使用以下命令安装scTenifoldNet ： library(remotes) install_github('cailab-tamu/scTenifoldNet') library(scTenifoldNet) 可用功能： 代码 功能 质量控制 执行单细胞数据质量控制 cpmNormalization 执行百万计数（CPM）数据归一化 网络 根据主成分回归计算基因调控网络 makeNetworks 基于主成
【文件预览】：
scTenifoldNet-master
----NAMESPACE(755B)
----DESCRIPTION(2KB)
----inst()
--------CITATION(900B)
----R()
--------scTenifoldNet.R(13KB)
--------cpmNormalization.R(2KB)
--------manifoldAlignment.R(4KB)
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--------dModularity.R(2KB)
--------makeNetworks.R(5KB)
--------pcNet.R(6KB)
--------dRegulation.R(5KB)
--------cpDecomposition.R(8KB)
--------asTensor.R(789B)
--------scQC.R(4KB)
----README.md(18KB)
----man()
--------cpmNormalization.Rd(2KB)
--------dRegulation.Rd(3KB)
--------scQC.Rd(3KB)
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--------scTenifoldNet.Rd(10KB)
--------makeNetworks.Rd(4KB)
--------cpDecomposition.Rd(2KB)
--------manifoldAlignment.Rd(3KB)
----tests()
--------testthat()
--------testthat.R(74B)
----MD5(2KB)