【文件属性】:
文件名称:biopandas:在熊猫DataFrames中处理分子结构
文件大小:2.85MB
文件格式:ZIP
更新时间:2021-05-01 09:21:40
bioinformatics pdb molecular-structures pandas-dataframe protein-structure
在熊猫DataFrames中处理分子结构
链接
文档: :
源代码存储库: :
PyPI: ://pypi.python.org/pypi/biopandas
如何贡献: : //rasbt.github.io/biopandas/contributing/
变更日志: ./ docs / sources / CHANGELOG.md
如果您是计算生物学家,则很有可能对蛋白质结构文件进行了太多次诅咒。 是的,我说的是Goode Olde蛋白质数据库格式,又名“ PDB文件”。 毫无疑问,PDB是一种结构整齐的格式(如果正确部署的话)。 但是,使用“现代”编程语言处理PDB文件有点麻烦-我很确定我们都同意这一点。
作为机器学习和“数据科学”的人,我爱上了熊猫DataFrames来处理几乎所有可以加载到内存中的内容。 那么,为什么我们不把熊猫带到结构生物学世界呢? 在熊猫