文件名称:circleGenome:这是一个小型 javascript 库,用于打印圆形基因组,使用 .gff 文件
文件大小:156KB
文件格式:ZIP
更新时间:2024-07-28 06:16:28
JavaScript
圆形基因组 这是一个小型 javascript 库,用于使用 .gff 文件打印圆形基因组。 它的设计非常轻巧,而不是包含众多功能、缩放、gc-plots、倾斜、超链接。 它对基因组特征进行环状注释,我希望它对质粒、环状染色体等有用。更轻量级使其能够被纳入可视化工作流程/管道,并作为生物信息学网站的一个组成部分。 它旨在具有以下 API: features_to_plot = [ 'tRNA' , 'CDS' , 'rRNA' ] ; genome_length = 159662 ; genome_name = 'Carsonella ruddii PV' ; gff_file = "NC_008512.gff" ; features_JSON = readGFF ( gff_file ) ; plotGenome ( genome_name , genome_length , fe
【文件预览】:
circleGenome-master
----Please.js(16KB)
----NC_008512.gff(122KB)
----test.html(797B)
----readGFF.js(2KB)
----carsonella_example.png(128KB)
----LICENSE(18KB)
----README.md(945B)
----circleGenome.js(9KB)