gff2gtf:用于将 GFF 文件转换为 GTF 的 AWK 脚本

时间:2024-06-29 23:57:03
【文件属性】:

文件名称:gff2gtf:用于将 GFF 文件转换为 GTF 的 AWK 脚本

文件大小:9KB

文件格式:ZIP

更新时间:2024-06-29 23:57:03

Awk

gff2gtf 用于将 GFF 文件转换为 GTF 的 AWK 脚本。 用法: awk -f gff2gtf.awk 文件.gff > 文件.gtf 适用于那些具有 AWK 解释器的操作系统。 该脚本依赖于记录的顺序。 规范不要求对 GFF 进行排序,但通常对记录进行排序。 对于 RSEM: awk -f gff2gtf-strict.awk FILE.gff > FILE.gtf grep -Ev "\sgene\s" FILE.gtf > rsem-ready.gtf 标签: NGS,下一代测序,遗传学,fasta,DNA,RNA,比对,基因组标记。


【文件预览】:
gff2gtf-master
----README.md(506B)
----gff2gtf-strict.awk(2KB)
----LICENSE(18KB)
----gff2gtf.awk(2KB)

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