文件名称：矩阵位移法matlab代码-anisotropy:各向异性
文件大小：291.43MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-06-09 07:59:50
系统开源
矩阵位移法matlab代码各向异性 数据处理和时空各向异性计算的代码概述 该存储库包含Matlab代码，用于处理SPT轨迹数据并计算多个时空尺度下的各向异性。 它还包含用于为HMM分类的SPT轨迹数据计算和拟合MSD的代码。 我们将首先描述一般的各向异性代码，最后描述HMM-MSD代码。 该代码与McSwiggen等人的论文“ DNA介导的核区室分离的证据不同于相分离”有关。 eLife，2019年。 快速教程：每一步 步骤1 ：在多个时间尺度上获取SPT数据在这里，我们将使用提供的U2OS C32 Halo-hCTCF示例数据，该数据在目录UnProcessedExampleData提供，并包含3种帧频的数据： UnProcessedExampleData Hz， UnProcessedExampleData Hz， UnProcessedExampleData Hz。 第2步：合并和QC来自许多不同单个单元格的SPT数据 打开脚本MergeQC_SPT_data.m ，然后单击运行（ MergeQC_SPT_data.m分钟）。 使用脚本合并来自多个单元格的数据。 相关函数： Re