文件名称：通过分析来自Pyrococcus abyssi的腈水解酶中带电基团位置变化探讨蛋白耐热机制 (2012年)
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更新时间：2024-06-05 01:29:02
自然科学 论文
蛋白含带电侧链基团的氨基酸的位置对蛋白质的热稳定性有很大的影响，目前，往往采用蛋白质结构模型“静态”分析这一影响。本文以1株耐热的腈水解酶作为研究对象，构建并异源表达了该酶，对其酶学性质进行初步分析。利用Discovery Studio对该酶进行同源建模，得到空间结构。将此空间结构利用Gromacs软件在不同温度下进行分子动力学(MD)模拟，使用Macrodox软件计算蛋白质所有带电氨基酸残基的包埋率与溶剂可接触性面积(SA)，发现在不同温度下，部分氨基酸带电基团的SA值会发生显著变化。说明通过静态分析并