文件名称：RevBayes_UC_Berkeley_2018_Workshop:加州大学伯克利分校2018 RevBayes研讨会
文件大小：1.91MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-05-22 11:47:41
phylogenetics probabilistic-programming graphical-models mcmc revbayes
RevBayes工作坊：系统发育图形模型和贝叶斯推断 加州大学伯克利分校，VLSB 1002 2018年2月26日至27日，12:00 PM至4:00 PM 讲师：Will Freyman 协调人：Carrie Tribble 部分由加州大学伯克利分校的数据科学计划 通过采用图形化模型框架表示了系统发育建模的基本概念，在该模型中，所有概率模型均由可通过多种方式组装的模块化组件组成。 图形模型使用高度灵活的类似于R的语言Rev来指定。 该研讨会的重点是使参与者能够使用Rev来从简单的组成部分指定定制的任意复杂的系统发育模型。 该教学将结合简短的讲座和简短的讲座，介绍每个推理问题的理论和概念基础，以及动手的计算机教程，演示如何使用探索这些问题。 尽管需要熟悉使用其他软件的系统发育推断，但不需要具有先前经验。 此次研讨会对所有感兴趣的人开放，包括IB以及以后的学生，教职员工，博士后和教师
【文件预览】：
RevBayes_UC_Berkeley_2018_Workshop-master
----.gitignore(26B)
----README.md(3KB)
----src()
--------plot_anc_states_BiSSE.R(841B)
--------correlated_reversible_jump.Rev(2KB)
--------plot_div_rates.R(4KB)
--------linear_regression_generative.Rev(776B)
--------plot_anc_states_ClaSSE.R(972B)
--------phylo.Rev(2KB)
--------mcmc_HiSSE.Rev(7KB)
--------plot_anc_states_HiSSE.R(825B)
--------mcmc_ClaSSE.Rev(10KB)
--------ancestral_states_joint.Rev(3KB)
--------multiplot.R(2KB)
--------plot_linear_regression.R(115B)
--------mcmc_BiSSE.Rev(5KB)
--------plot_div_rates_multi_rate.R(2KB)
--------independent_Bayes_factors.Rev(1KB)
--------linear_regression.Rev(677B)
--------correlated_Bayes_factors.Rev(2KB)
--------ancestral_states_conditional.Rev(1KB)
----data()
--------primates_solitariness.nex(5KB)
--------primates_terrestrially.nex(5KB)
--------primates_diet_class.nex(5KB)
--------phylo.tree(1KB)
--------primates_activity_period.nex(5KB)
--------primates_morph.nex(10KB)
--------phylo_morph.nex(335B)
--------primates_habitat.nex(5KB)
--------primates_mating_system.nex(5KB)
--------primates_tree.nex(17KB)
--------y.csv(569B)
--------primates_males_in_group.nex(5KB)
--------x.csv(503B)
--------primates_biogeo.tre(3KB)
--------correlated.nex(339B)
--------primates_missing.nex(5KB)
--------primates_biogeo.tsv(500B)
--------phylo_mol.nex(12KB)
--------primates_morph_description.txt(344B)
----slides()
--------.gitignore(6B)
--------RB_DiversificationRate_CharacterDependent_Tutorial.pdf(749KB)
--------Freyman_RevBayes_Graphical_Models.pdf(436KB)
--------makefile(466B)
--------figures()
--------Freyman_RevBayes_Correlated_Evolution.pdf(243KB)
--------Freyman_RevBayes_Graphical_Models.tex(20KB)
--------Freyman_RevBayes_Correlated_Evolution.tex(10KB)