文件名称:mgkit:MGKit:元基因组学框架
文件大小:11.07MB
文件格式:ZIP
更新时间:2024-02-29 01:46:43
bioinformatics metagenomics microbiology metagenomic-pipeline Python
MGKit:元基因组学框架 该库的目的是提供一系列有用的模块和软件包,以使构建宏宏基因组学或任何种类的生物信息学分析的自定义管道变得更加容易。 它在生物信息学中集成了其他知名的python库,例如 , , 和 。 可从获得文档。可以从获得文档中使用的数据和脚本。 讨论邮件列表可从。 使用MGKit的论文 Rubino,F.,Carberry,C.,M Waters,S.,Kenny,D.,McCabe,MS,&Creevey,CJ(2017年)。 不同的功能同工型驱动小生境专业化,以获取营养并在瘤胃微生物组中使用。 ISME杂志,1-13。 Lambert,BS,Raina,JB,Fernandez,VI,Rinke,C.,Siboni,N.,Rubino,F.,…Stocker,R.(2017)。 基于微流控技术的原位趋化分析,以研究水生微生物群落的行为。 自然微生物学,2(