NGSReadsTreatment:注意：要运行新版本，请使用 Java 版本 13。-开源

【文件属性】：

文件名称：NGSReadsTreatment:注意：要运行新版本，请使用 Java 版本 13。-开源

文件大小：271KB

文件格式：JAR

更新时间：2024-06-21 21:03:10

开源软件

NGSReadsT​​reatment，一种用于去除双端或单端数据集中重复读数的计算工具。 NGSReadsT​​reatment 可以处理来自任何平台的具有相同或不同序列长度的读取。 使用概率结构Cuckoo Filter，通过将reads与其自身进行比较来识别和去除冗余reads。 因此，除了读取集之外不需要任何先决条件。 NGSReadsT​​reatment 与其他冗余删除工具在分析不同的读取集时进行了比较。 结果表明，NGSReadsT​​reatment 在删除的冗余量和所有执行分析的计算内存使用方面都优于其他工具。 要执行多线程版本，在命令行的末尾添加将用于处理的线程数，值得一提的是，该数字必须是 2 的幂。 注意：要运行新版本，请使用 Java 版本 13。