ndar-dev:NDAR 软件开发

时间:2024-06-30 14:10:18
【文件属性】:

文件名称:ndar-dev:NDAR 软件开发

文件大小:57KB

文件格式:ZIP

更新时间:2024-06-30 14:10:18

Python

ndar-dev 该存储库包含用于预处理来自 NDAR 数据库的数据并将结果/日志文件上传到数据库中的表的代码。 内容 遵守_上传 - 包含脚本的文件夹,用于将 ABIDE 数据从上传到 miNDAR 数据库实例表。 act_interface.py - Nipype 界面与找到的 ANTs 皮质厚度提取脚本一起使用 act_sublist_build.py - 模板主题列表构建器脚本,它将查询 IMAGE03 数据库表并下拉一系列 image03_id 及其相应的 S3 路径条目以构建主题列表。 然后可以使用此主题列表运行 ndar_act_run.py 以进行 ANT 皮质厚度处理。 aws_walkthrough.md - 有关如何使用 AWS EC2 启动 C-PAC AMI 并与之交互的说明。 check_entries.py - 一个质量控制脚本,用于分析 miNDAR


【文件预览】:
ndar-dev-master
----.gitignore(573B)
----aws_walkthrough.md(11KB)
----ndar_act_run.py(26KB)
----act_interface.py(5KB)
----check_entries.py(14KB)
----ndar_unpack(35KB)
----README.md(6KB)
----abide_upload()
--------ants_insert.py(17KB)
--------insert_utils.py(13KB)
--------freesurfer_insert.py(11KB)
--------insert_abide_results.py(4KB)
--------recon_stats()
--------civet_insert.py(14KB)
----fetch_creds.py(6KB)
----ndar_cpac_sublist.py(22KB)
----ndar_run.sge(248B)
----credentials_template.csv(211B)
----act_sublist_build.py(3KB)

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