文件名称：hot-mice:放射性森林小鼠的肠道微生物-切尔诺贝利和福岛
文件大小：3.85MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-04-27 17:21:28
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分析笔记本 野生啮齿动物肠道微生物组对人为栖息地污染的可比响应 该存储库包含用于分析Lavrinienko等人中的数据的代码。 2021. Jupyter Notebook包含用于处理原始读取数据，重现qiime2分析，一些统计数据和主要数据的命令。 该存储库提供主要数据文件，即元数据，dada2特征表，代表性序列，系统树和分类法。 使用这些文件和命令应该可以生成其余数据。 这项研究的原始序列数据已保存在EMBL-EBI的欧洲核苷酸档案库（ENA）中，登录号为 。 为了分析这些数据，我们使用提供的计算资源和基础架构。 如果您在研究中使用此资源，请引用以下： 要求 qiime2是运行以下描述的大多数命令所必需的（已使用2019.4 qiime2版本）。 要安装qiime2，请遵循指示。 文件说明 qiime2分析笔记本：github-ver-hot-mice.ipynb（github-v