文件名称:actout:重写我的论文项目(https
文件大小:68KB
文件格式:ZIP
更新时间:2024-07-30 07:08:32
C++
表演 actout 是用于肌动蛋白丝动力学的蒙特卡罗模拟器。 它使用 Gillespie 算法高效实现。 项目状态 目前处于初步开发阶段。 这意味着从我迁移核心算法并进行一些改进以使某些功能(例如阻碍聚合的物理屏障、细丝切断和退火,以及可能的细丝分支)更容易实现。 核心代码迁移完成后,我将开始研究一个合理的界面和命令行实用程序,以启用基本用法。 一旦到位,我将尝试实际使用代码进行研究,看看有什么额外的需求出现并从那里开始工作。 该项目的一个重要目标是摆脱与旧项目相关的重大问题,因此复杂的数据库后端将被抛在后面,除非并且直到它被认为确实有必要。 安装 依赖关系 一个对 c++ 11 友好的编译器——该代码目前使用 gcc 4.6、clang 3.0 和 clang 3.2 进行测试。 促进 制作 谷歌协议缓冲区 谷歌测试 要查看特定的 (Ubuntu) 依赖项,请查看 .travis
【文件预览】:
actout-master
----.travis.yml(469B)
----cmake()
--------TestHelper.cmake(801B)
--------ProjectHelper.cmake(504B)
--------CompilerConfig.cmake(647B)
----test()
--------lib()
----src()
--------lib()
--------exe()
----doc()
--------conf.py.in(8KB)
--------Doxyfile.in(78KB)
--------index.rst.in(555B)
--------CMakeLists.txt(1KB)
----.gitignore(23B)
----CMakeLists.txt(467B)
----README.md(2KB)