文件名称：de-novo-transcriptome-assembly-pipeline:从头组合转录组组装-多个汇编程序-多个参数
文件大小：43KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-04-22 02:59:16
Shell
从头转录组装配流程 该流水线使用组合的从头转录组组装流水线将多个汇编器和多个参数组合在一起。 有关更多信息，请转到 如有其他疑问，请联系NCGAS团队（ ） 该管道当前仅设置了TORQUE作业处理程序（SLURM正在进行中，将很快更新），当前设置是针对IU Carbonate Cluster。 如果您想在自己的硬件上运行它，我们可以帮助您将脚本转换为在您的计算机上运行。 阅读自述文件。 每个文件夹中都有自述文件。 步骤0： 您将需要运行启动脚本来设置您的电子邮件，项目位置，并指定您是使用单链还是双链。 可以使用以下命令完成此操作： Setup.ba -e -s -r -i @@ -29,21 +29,21 @@您可以使用以下方法获得所有软件的引用：注：您可以多次更改电子邮件和链设置，但当前可以使用目录将仅在第一次运行。 只要您不移动目录，就不会造成任何问题。 另外，此步骤可能需要
【文件预览】：
de-novo-transcriptome-assembly-pipeline-master
----Installation_notes.md(6KB)
----Project_Carbonate_v4()
--------TransAbyss()
--------setup_files()
--------Trinity()
--------Setup.ba(3KB)
--------input_files()
--------Velvet()
--------final_assemblies()
--------README(4KB)
--------SOAP()
----LICENSE(120B)
----README.md(4KB)