文件名称：l-曲线matlab代码-SSM:统计形状建模
文件大小：1.03MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-06-13 02:25:30
系统开源
l-曲线矩阵代码统计形状建模（SSM） 此Matlab代码是由Jan Bruse博士和Benedetta Biffi博士于2017年创建的。它包含一个Matlab GUI界面，该界面调用了另外两个负责PCA和形状注册的免费软件：Deformetrica 4.2（）和VMTK 1.4（）以允许统计形状建模（SSM）为用户带来流畅的体验。 SSM是一种工具，可用于计算一致的几何系列（或训练集）内的平均形状及其变化。 它基于以下假设：族的每个形状都是参考形状的变形版本。 它对一组界标点使用主成分分析（PCA）来描述对象的形状。 参考文献： Durrleman，Stanley等。 “具有密集变形和稀疏参数的解剖形状复合体的形态计量学。” NeuroImage 101（2014）：35-49。 伯恩（Bône），亚历山大（Alexandre）等人。 “ Deformetrica 4：用于统计形状分析的开源软件。” 国际医学影像形状研讨会。 占卜·斯普林格，2018年。 Antiga，Luca等。 “基于图像的建模框架，可用于特定于患者的计算血流动力学。” 医学与生物工程与计算46.11（2008
【文件预览】：
SSM-master
----README.md(9KB)
----MatlabScripts()
--------SparseAtlas3Matlab.m(4KB)
--------plotTemplateDistance.m(1KB)
--------RegistrationAtlasConstruction.m(6KB)
--------AtlasConstruction.m(2KB)
--------readInFilenames.m(1KB)
--------setParamDiffeosSurface.m(5KB)
--------surfaceDistance.m(2KB)
--------importDATdistances.m(2KB)
--------DistanceResults.vtk(330KB)
--------setMomInXml.m(992B)
--------ICPregistrationMATLAB.m(5KB)
--------data()
--------WriteASCII.m(1KB)
--------registration.m(11KB)
----Illustrations()
--------Screenshot_Menu1.png(20KB)
--------Screenshot_EndSession1.png(22KB)
--------GPA_IterationFolders.png(338KB)
--------DistIteration1.png(21KB)
--------CodeArchitecture.png(194KB)
--------DistIteration2.png(33KB)
--------Screenshot_EndSession2.png(19KB)
--------Screenshot_Menu2.png(30KB)
--------Screenshot_DeformetricaParameters.png(30KB)
----ShapeAnalysis_OnlyPCA_2020.m(4KB)
----python()
--------README.md(1KB)
--------ressources()
--------ssm_tools.py(7KB)
--------main_ssm.py(3KB)
--------visualization_tools.py(2KB)
--------volumetric_meshes.py(3KB)
--------ssm_pca.py(7KB)
--------create_data_set_xml.py(3KB)
--------SSM - demo.ipynb(120KB)
--------ssm_atlas.py(18KB)
--------doc()