【文件属性】:
文件名称:l-曲线matlab代码-SSM:统计形状建模
文件大小:1.03MB
文件格式:ZIP
更新时间:2021-05-24 08:38:50
系统开源
l-曲线矩阵代码统计形状建模(SSM)
此Matlab代码是由Jan
Bruse博士和Benedetta
Biffi博士于2017年创建的。它包含一个Matlab
GUI界面,该界面调用了另外两个负责PCA和形状注册的免费软件:Deformetrica
4.2()和VMTK
1.4()以允许统计形状建模(SSM)为用户带来流畅的体验。
SSM是一种工具,可用于计算一致的几何系列(或训练集)内的平均形状及其变化。
它基于以下假设:族的每个形状都是参考形状的变形版本。
它对一组界标点使用主成分分析(PCA)来描述对象的形状。
参考文献:
Durrleman,Stanley等。
“具有密集变形和稀疏参数的解剖形状复合体的形态计量学。”
NeuroImage
101(2014):35-49。
伯恩(Bône),亚历山大(Alexandre)等人。
“
Deformetrica
4:用于统计形状分析的开源软件。”
国际医学影像形状研讨会。
占卜·斯普林格,2018年。
Antiga,Luca等。
“基于图像的建模框架,可用于特定于患者的计算血流动力学。”
医学与生物工程与计算46.11(2008
【文件预览】:
SSM-master
----README.md(9KB)
----MatlabScripts()
--------SparseAtlas3Matlab.m(4KB)
--------plotTemplateDistance.m(1KB)
--------RegistrationAtlasConstruction.m(6KB)
--------AtlasConstruction.m(2KB)
--------readInFilenames.m(1KB)
--------setParamDiffeosSurface.m(5KB)
--------surfaceDistance.m(2KB)
--------importDATdistances.m(2KB)
--------DistanceResults.vtk(330KB)
--------setMomInXml.m(992B)
--------ICPregistrationMATLAB.m(5KB)
--------data()
--------WriteASCII.m(1KB)
--------registration.m(11KB)
----Illustrations()
--------Screenshot_Menu1.png(20KB)
--------Screenshot_EndSession1.png(22KB)
--------GPA_IterationFolders.png(338KB)
--------DistIteration1.png(21KB)
--------CodeArchitecture.png(194KB)
--------DistIteration2.png(33KB)
--------Screenshot_EndSession2.png(19KB)
--------Screenshot_Menu2.png(30KB)
--------Screenshot_DeformetricaParameters.png(30KB)
----ShapeAnalysis_OnlyPCA_2020.m(4KB)
----python()
--------README.md(1KB)
--------ressources()
--------ssm_tools.py(7KB)
--------main_ssm.py(3KB)
--------visualization_tools.py(2KB)
--------volumetric_meshes.py(3KB)
--------ssm_pca.py(7KB)
--------create_data_set_xml.py(3KB)
--------SSM - demo.ipynb(120KB)
--------ssm_atlas.py(18KB)
--------doc()