augustus:用于在Mac OS X上安装的AUGUSTUS v3.2.1

时间:2024-06-06 22:50:40
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文件名称:augustus:用于在Mac OS X上安装的AUGUSTUS v3.2.1

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更新时间:2024-06-06 22:50:40

C++

奥古斯都 用于在Mac OS X上安装的AUGUSTUS v3.2.1 AUGUSTUS v3.2.1从下载。 随后对Makefile进行了修改,使其可以在Mac OSX上编译并正常运行。 问题似乎出在ProteinProfile函数中,如果使用Mac clang++编译,则每次您尝试使用ProteinProfile方法时都会抛出错误-因此Augustus不适用于BUSCO。 解决方法是使用g++ v4.8或更高版本,我使用homebrew安装gcc,当前会得到gcc-7 ,您可以使用brew install gcc进行brew install gcc 。 此安装的另一个主要麻烦是将Bamtools正确链接到auxprogs文件夹中的附件脚本/程序。 这里的重点似乎是(至少这是我可以使其正常工作的唯一方法)是确保用来构建Bamtools v2.4.0的同一编译器也可以用来编译这些辅助程


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