文件名称:matlab导入excel代码-IVEN-Code:IVEN背后所有代码和教程的存储库
文件大小:53.05MB
文件格式:ZIP
更新时间:2024-06-10 03:27:44
系统开源
matlab导入excel代码IVEN代码 伊文 免费软件的存储库-IVEN(内部与外部邻居量化)。 IVEN是一个平台,能够帮助分析生物数据集并询问系统的邻域特征。 使用凸包算法将单元划分为内部还是外部,然后使用“校正的” Delaunay三角剖分计算单元的邻居数。 MATLAB版本: 此版本的IVEN包括更广泛的GUI使用,通常建议将其与IVEN初步配合使用(特别是如果那些不一定熟悉编码的人正在使用的话)。 该版本是在2020年的MATLAB版本中开发的,其中一些功能(最著名的是导入excel文件)需要稍作更改才能在旧版本的MATLAB中运行。 当前版本是使用Windows开发的,因此可能需要在Mac OS上更改一些文件输出(如Excel文档),请参见教程。 注意:需要统计和机器学习工具箱。 Python 3版本: 此版本包括简化和更快的GUI,以帮助进行小区分类(内部与外部),但采用硬编码方法来选择邻居距离的阈值。 必须按照教程中的建议对邻居的阈值方式进行任何更改。 可用的教程: -数据组装以输入IVEN管道-IVEN邻居距离阈值建议-IVEN参数更改-IVEN在MATLAB中使
【文件预览】:
IVEN-Code-main
----Example_Data()
--------em2_7June19E3.5PDxCD110amEcadSOX2CDX2.xls(234KB)
--------em1_7June19E3.5PDxCD110amEcadSOX2CDX2.xls(240KB)
--------em3_7June19E3.5PDxCD110amEcadSOX2CDX2.xls(228KB)
--------em4_7June19E3.5PDxCD110amEcadSOX2CDX2.xls(228KB)
----.gitattributes(66B)
----Python Version()
--------final_data_display.py(2KB)
--------run_IVEN.py(6KB)
--------funcs.py(15KB)
--------__pycache__()
----Tutorials()
--------VIDEO-Data Assembly.avi(10.4MB)
--------IVEN Parameter Change Tutorial.docx(731KB)
--------VIDEO-MATLAB IVEN.avi(17.24MB)
--------IVEN Neighbour Distance Threshold Advice.docx(405KB)
--------VIDEO-Python IVEN.avi(10.07MB)
--------VIDEO- Python Display Final Figure.avi(5.45MB)
--------IVEN Use in Python.docx(15.32MB)
--------Data Assembly for Input into IVEN Pipeline.docx(3.53MB)
--------IVEN Use in Matlab.docx(3.84MB)
----MATLAB2020 Version()
--------run_IVEN.m(6KB)
--------output_file_3chan.m(2KB)
--------dt_nbr_calc.m(6KB)
--------median_nbr_dist_calc.m(550B)
--------outside_selection.m(9KB)
--------finalfig.m(1KB)
--------import_2chan_data.m(528B)
--------thresholdChoice.m(2KB)
--------nbr_list_gen.m(514B)
--------import_3chan_data.m(609B)
----Data Post-Process (in MATLAB)()
--------post_data_process.m(3KB)
--------figure_generation_muralvspolar.m(3KB)
--------import_nbr_file.m(855B)
--------intialise_arrays.m(880B)
--------import_nbr_file_python.m(917B)
----README.md(2KB)