pafr:读取,操作和可视化R中的“成对mApping格式”数据

时间:2024-05-29 05:46:04
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文件名称:pafr:读取,操作和可视化R中的“成对mApping格式”数据

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更新时间:2024-05-29 05:46:04

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帕夫 读取,操作和可视化R中的“成对mApping格式”数据 安装 该软件包在CRAN上尚不可用,但是我们将保持此存储库的master分支稳定。 您可以使用devtools进行安装 # install.packages(devtools) devtools :: install_github( " dwinter/pafr " ) 读入.paf文件并检出 安装软件包后,制作全基因组点图就像读取比对并调用dotplot一样简单: library( pafr , quietly = TRUE ) test_alignment <- system.file( " extdata " , " fungi.paf " , package = " pafr " ) ali <- read_paf( test_alignment ) dotplot( ali ) R中的一个paf文件 read_paf


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