【文件属性】：
文件名称：pafr:读取，操作和可视化R中的“成对mApping格式”数据
文件大小：4.17MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-05-29 05:46:04
R
帕夫
读取，操作和可视化R中的“成对mApping格式”数据
安装
该软件包在CRAN上尚不可用，但是我们将保持此存储库的master分支稳定。 您可以使用devtools进行安装
# install.packages(devtools)
devtools :: install_github( " dwinter/pafr " )
读入.paf文件并检出
安装软件包后，制作全基因组点图就像读取比对并调用dotplot一样简单：
library( pafr , quietly = TRUE )
test_alignment <- system.file( " extdata " , " fungi.paf " , package = " pafr " )
ali <- read_paf( test_alignment )
dotplot( ali )
R中的一个paf文件
read_paf