文件名称：dgenies:以交互，高效和简单的方式对大型基因组进行点图绘制
文件大小：4.61MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-06-05 03:15:06
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D精灵 点图被广泛用于快速比较序列集。 它们提供了综合的相似性概述，突出了重复，中断和倒置。 已经开发了不同的工具来容易地生成基因组比对点图，但是它们通常在输入序列大小上受到限制。 D-GENIES是一个独立的Web应用程序，使用软件包执行大型基因组比对并生成交互式点图。 它使用户能够沿参考点对查询序列进行排序，放大图并下载多个图像，比对或序列文件。 D-GENIES是使用Python和JavaScript开发的易于安装的开源软件包（GPL）。 如何使用？ 您可以在使用演示实例。 或者，您可以安装自己的实例。 安装文档可。 文献资料 包括代码API在内的完整文档可。 如何引用？ Cabanettes F，Klopp C.（2018）D-GENIES：以交互，高效和简单的方式点绘制大型基因组。 PeerJ 6：e4958 学分 D-Genies由Genotoul平台（ INRA ）