Jutils:差异化拼接事件的可视化工具包

时间:2024-04-19 04:58:50
【文件属性】:

文件名称:Jutils:差异化拼接事件的可视化工具包

文件大小:100.25MB

文件格式:ZIP

更新时间:2024-04-19 04:58:50

Python

杰蒂斯 Jutils(1.0版)是用于替代剪接事件的可视化工具包。 Jutils直接支持可视化差分拼接(DS)检测工具MntJULiP,LeafCutter,MAJIQ和rMATS生成的结果,并且可以轻松地与其他DS软件配合使用。 描述于: Yang G,Cope L,He Z和Florea L.(2020年)Jutils:用于差异化可变剪接事件的可视化工具包, Submitted 。 本文中描述的补充和数据可以在“ ”目录中找到。 Copyright (C) 2020-2021, and GNU GPL v3.0, by Guangyu Yang, Liliana Florea 该程序是免费软件:您可以根据*软件基金会发布的GNU通用公共许可的条款(许可的版本3)或(根据您的选择)任何更高版本来重新分发和/或修改它。 目录 安装 Jutils用Python编写


【文件预览】:
Jutils-master
----venn.py(21KB)
----convert_results_utils.py(15KB)
----venn_diagram_utils.py(3KB)
----data()
--------leafcutter()
--------mntjulip()
--------majiq()
--------pngs_all_programs.tar.gz(18.28MB)
--------rmats()
--------.DS_Store(6KB)
--------mntjulip_meta_file.tsv(438B)
--------results.tsv.zip(28.7MB)
--------gencode.vM17.annotation.clean.gtf.gz(17.94MB)
--------test_jutils.sh(5KB)
----sashimi_utils.py(40KB)
----LICENSE(34KB)
----heatmap_utils.py(14KB)
----README.md(18KB)
----notes()
--------aggregates.md(931B)
----jutils.py(9KB)

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