文件名称:AMi_Image_Analysis:AMi_Image_Analysis
文件大小:44.36MB
文件格式:ZIP
更新时间:2024-03-25 17:58:30
crystallization Python
AMi图像分析:自动化显微镜图像分析 这是一个Python 3 / PyQt5项目,致力于分析低成本自动显微镜AMi显微镜产生的图像。 有关此设备的更多详细信息,请查看:“ AMi:基于GUI的开放源系统,用于对多Kong板中的样品进行成像” 如果文件夹树符合预期,则此程序应可与其他机器拍摄的图像配合使用(请参见下文)。 特征: 我创建此应用程序是为了帮助我们实验室的成员进行结晶工作。 该软件可以读取tiff,jpeg或png文件。 通过单击相应的Kong按钮或使用键盘快捷键进行导航,可以访问图像。 如果可获得在不同时间拍摄的同一口井的几张照片,则可以缩放图像以进行全面检查,并显示相应井的时间轴。 使用“丢弃分数”部分对图像进行评分。 可以记录笔记并将其保存到文件中。 当前井的报告可以另存为pdf。 结果可以显示在网格上,还可以计算统计数据。 该树必须按照以下方式组织:
【文件预览】:
AMi_Image_Analysis-master
----.gitignore(281B)
----Check_Circle_detection.py(3KB)
----Setup.py(11KB)
----autocrop.py(5KB)
----HeatMap_Grid.py(2KB)
----requirements.txt(111B)
----requirements_OSX.txt(107B)
----screenshot1.png(540KB)
----StatisticsDialog.py(5KB)
----MARCO_Results_Analysis.py(5KB)
----bin()
--------autocrop.py(14B)
--------SaveDiskSpace.py(25B)
--------Merge_AllNewPlates.py(30B)
--------AMI_Image_Analysis.sh(377B)
--------Merge_Zstack.py(24B)
----AMi_Image_Analysis.py(62KB)
----pdf_writer.py(4KB)
----SplashScreen.png(706KB)
----LICENSE(1KB)
----INSTALL.txt(7KB)
----AMi_IA.png(26KB)
----ReadScreen.py(3KB)
----tools()
--------SaveDiskSpace.py(3KB)
--------Merge_AllNewPlates.py(15KB)
--------Merge_Zstack.py(16KB)
----utils.py(1KB)
----requirements_Raspbian.txt(91B)
----Automated_Marco.py(4KB)
----README.md(8KB)
----master_refs.bibtex(1KB)
----saved_model()
--------variables()
--------LICENCE(689B)
--------saved_model.pb(1.98MB)
----gui.py(41KB)
----Screen_Database()
--------HR-PEGRx_HT_screen.csv(12KB)
--------JBScreen_Classic_5-8.csv(8KB)
--------JBScreen_Classic_1-4.csv(9KB)
--------Jena-Pi-PEG_Screen_HTS.csv(10KB)
--------HR-Cryo_HT_screen.csv(13KB)
--------HR-SaltRx_HT_screen.csv(8KB)
--------NeXtal-MbClass-II-Suite.csv(7KB)
--------NeXtal-Protein-Complex-Suite.csv(6KB)
--------Md1-36_PACT_Premier_HT.csv(6KB)
--------JBScreen_Classic_HTS_I.csv(9KB)
--------NeXtal-AmSO4-Suite.csv(5KB)
--------NeXtal-Classics-Suite.csv(6KB)
--------Md1-51_pga_screen.csv(10KB)
--------Md1-105_BCS_Screen.csv(9KB)
--------NeXtal-JCSG-Plus-Suite.csv(7KB)
--------Jena-JCSGPlusPlus.csv(10KB)
--------Md1-40_jcsg_plus.csv(7KB)
--------NeXtal-Nucleix-Suite.csv(10KB)
--------NeXtal-PEGs-II-Suite.csv(6KB)
--------JBScreen_Classic_HTS_II.csv(7KB)
--------Md1-107_MIDASPlus.csv(7KB)
--------NeXtal-ClassicsII-Suite.csv(6KB)
----screenshot2.png(449KB)
----Setup_bin_VENV.py(5KB)
----AutoMARCO_Grid.py(5KB)
----preferences.py(2KB)
----screenshot3.png(326KB)
----Manual_AMi_Image_Analysis.pdf(1.32MB)