【文件属性】：
文件名称：Lolium_rigidum_genome_assembly_and_annotation:黑麦草基因组装配与注释
文件大小：677KB
文件格式：ZIP
更新时间：2021-04-05 06:33:53
Shell
黑麦草基因组装配与注释
刚性黑麦草的组装，L。基因组和基因组注释。
实验室网站
执照
我们的目标是产生比紧密相关的饲草作物更好的基因组装配和基因组注释。 暂定的基因组组装工作流程如下图所示：
基因组注释管道尚未起草（需要更新）：
我们正在使用的软件链接如下：
奥古斯都和
【文件预览】：
Lolium_rigidum_genome_assembly_and_annotation-main
----assembly_01_error_correction.sh(2KB)
----hybrid_02_wengan.sh(1KB)
----minion_02_filter_trim_QC.sh(3KB)
----00_prep_directories.sh(365B)
----minion_00_software_installation.sh(1KB)
----illumina_02_asembly_minia.sh(1KB)
----LICENSE(34KB)
----assembly_02_statistics.sh(4KB)
----README.md(2KB)
----hybrid_00_software_installation.sh(626B)
----annotation_01_augustus.sh(14KB)
----minion_01_fast5_to_fastq.sh(2KB)
----minion_03_assembly_wtdbg2.sh(2KB)
----illumina_00_software_installation.sh(2KB)
----illumina_01_QC_error_correct.sh(3KB)
----misc()
--------illumina_genewiz_download_fastq()
--------Lori_im.svg(889KB)
--------assembly_pipeline.svg(65KB)
--------Lolium_perenne_draft_genome_distribution_N50_L50.svg(516KB)
--------annotation_pipeline.svg(50KB)
--------Lori_mw.svg(599KB)
--------Lori_mw_TSR_blast.out(973B)
--------Adaptive Evolution Logo mod.png(70KB)
--------Lori_mw_blast_DETAILED.out(29KB)
--------braker2_pipeline_D.png(67KB)
--------Lori_hh.svg(585KB)
----annotation_00_software_installation.sh(2KB)
----hybrid_01_haslr.sh(1KB)