【文件属性】:
文件名称:QDeep:使用深度ResNets进行基于距离的蛋白质模型质量评估
文件大小:70.88MB
文件格式:ZIP
更新时间:2021-02-11 23:21:19
deep-learning protein-structure-prediction protein-scoring-functions protein-model-quality-estimation Python
QDeep
使用深度ResNet的基于距离的蛋白质模型质量评估
目录
入门
可以通过键入QDeep下载
$ git clone https://github.com/Bhattacharya-Lab/QDeep.git
先决条件
Linux系统:QDeep已在x86_64 Linux系统上进行了测试。 当前,Windows或Mac上不支持QDeep
python 3.6或更高版本
tensorflow 1.13.1或更高版本
keras 2.3.1或更高版本
numpy 1.14.5或更高版本
Pyrosetta Python-3.6版本:pyrosetta-2019.45及更高版本或更高版本( )
安装
如果您没有python 3.6版本,则可以从以下位置下载并安装。
如果您没有“ tensorflow”软件包,请输入$ pip install tensorflow
如果您没有“
【文件预览】:
QDeep-master
----configure.py(646B)
----models()
--------QDeep_standard()
--------QDeep_deep()
----example()
--------QDeep_standard()
--------QDeep_deep()
----QDeep.py(74KB)
----LICENSE(34KB)
----README.md(7KB)
----run.log(2KB)
----apps()
--------dssp(857KB)
--------aleigen(1.02MB)
--------stride(157KB)
--------calNf_ly(1.6MB)
----scripts()
--------pdb2rr.pl(5KB)
--------ros_energy.py(9KB)