QDeep:使用深度ResNets进行基于距离的蛋白质模型质量评估

时间:2021-02-11 23:21:19
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文件名称:QDeep:使用深度ResNets进行基于距离的蛋白质模型质量评估
文件大小:70.88MB
文件格式:ZIP
更新时间:2021-02-11 23:21:19
deep-learning protein-structure-prediction protein-scoring-functions protein-model-quality-estimation Python QDeep 使用深度ResNet的基于距离的蛋白质模型质量评估 目录 入门 可以通过键入QDeep下载 $ git clone https://github.com/Bhattacharya-Lab/QDeep.git 先决条件 Linux系统:QDeep已在x86_64 Linux系统上进行了测试。 当前,Windows或Mac上不支持QDeep python 3.6或更高版本 tensorflow 1.13.1或更高版本 keras 2.3.1或更高版本 numpy 1.14.5或更高版本 Pyrosetta Python-3.6版本:pyrosetta-2019.45及更高版本或更高版本( ) 安装 如果您没有python 3.6版本,则可以从以下位置下载并安装。 如果您没有“ tensorflow”软件包,请输入$ pip install tensorflow 如果您没有“
【文件预览】:
QDeep-master
----configure.py(646B)
----models()
--------QDeep_standard()
--------QDeep_deep()
----example()
--------QDeep_standard()
--------QDeep_deep()
----QDeep.py(74KB)
----LICENSE(34KB)
----README.md(7KB)
----run.log(2KB)
----apps()
--------dssp(857KB)
--------aleigen(1.02MB)
--------stride(157KB)
--------calNf_ly(1.6MB)
----scripts()
--------pdb2rr.pl(5KB)
--------ros_energy.py(9KB)

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