trix-js:使用纯JavaScript读取UCSC Trix索引

时间:2024-04-25 20:04:10
【文件属性】:

文件名称:trix-js:使用纯JavaScript读取UCSC Trix索引

文件大小:92.37MB

文件格式:ZIP

更新时间:2024-04-25 20:04:10

TypeScript

trix-js 使用纯JavaScript读取UCSC Trix索引 测试trix-js 首先,克隆此仓库并安装npm软件包。 然后,运行npm test 。 测试USCS TrixSearch-需要Linux 首先,克隆此仓库。 要使用USCS TrixSearch在跟踪中心上运行测试搜索,请导航到tests/testdata/test#并运行bash test#script.sh ,其中#是测试编号。 要更改搜索词,请编辑searchterms.txt 。 想知道要搜索什么? 打开tests/testdata/test#/input.txt 。 如何测试自己的.gff.gz数据? 导航到/test/rawGenomes并创建一个包含.gff.gz文件的目录。 在该目录中,运行bash ../../programs/gff3ToInput.sh <.gff3.gz FILE>


【文件预览】:
trix-js-main
----src()
--------index.ts(7KB)
----tsconfig.json(1KB)
----LICENSE(11KB)
----test()
--------testMetrics.txt(7KB)
--------rawGenomes()
--------testData()
--------programs()
--------search.test.ts(7KB)
--------__snapshots__()
----README.md(737B)
----.gitignore(35B)
----package-lock.json(1.13MB)
----package.json(1KB)

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