文件名称：ShapeShifter:减少形态复杂性的程序
文件大小：388KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-04-05 20:17:08
Python
描述 shape_shifter是一个形态转换器，它接收神经元形态文件（.swc或Genesis .p），并简化形态，以便在模型仿真中更有效地使用。 shape_shiter可以合并半径相同（或相似）且合并长度小于电声长度指定值的隔室组，并使用AC或DC方法计算。 该程序的先前试验已使原始文件减少了近90％，并且在模拟时具有相同的原始（未减少）响应，从而极大地提高了处理速度。 shape_shifter也可以用于将具有极长间隔的简单形态转换为具有相同拓扑结构（连接性）的较小间隔。 输入文件 shape_shifter将接受.swc或.p形态文件进行形态转换。 可以从NeuroMorpho存储库通过获取形态文件（.swc）。 shape_shifter用法 输入： python3 shape_shifter.py --file 'filename.swc' --type 'conden
【文件预览】：
ShapeShifter-master
----morph_feature_analysis.py(28KB)
----cvapp.jar(83KB)
----convert_swc_pfile.py(3KB)
----extract_dynamic.py(3KB)
----shape_shifter.py(30KB)
----btmorph()
--------population_density_plots.pyc(8KB)
--------btstats.pyc(27KB)
--------modified1.swc(218KB)
--------btviz.pyc(20KB)
--------grids.pyc(16KB)
--------__init__.pyc(1KB)
--------tools()
--------grids.py(17KB)
--------population_density_plots.py(11KB)
--------btviz_dynamic.pyc(4KB)
--------btstructs2.pyc(21KB)
--------modified.swc(218KB)
--------__init__.py(725B)
--------box_counting.pyc(5KB)
--------btviz.py(25KB)
--------modified.swc~(218KB)
--------box_counting.py(6KB)
--------btviz_dynamic.py(5KB)
--------config.py(245B)
--------btstats.py(27KB)
--------btstructs2.py(21KB)
--------config.pyc(378B)
----README.md(6KB)
----morph_feature_extract.py(11KB)