文件名称:fujiplot:富士图-多个GWAS结果的马戏团表示-
文件大小:1.31MB
文件格式:ZIP
更新时间:2024-06-16 21:09:14
R
:mount_fuji: 富士情节 :mount_fuji: 多个GWAS结果的马戏表演。 概述 开发了Fuji图(多个GWAS结果的马戏团表示),以有效总结数十个性状中的重要SNP( )。 从技术上讲,它是的包装脚本,可从GWAS结果生成输入数据和配置文件。 富士情节以名字命名 :mount_fuji: 公吨。 日本富士 :mount_fuji: ,其山脊和裙子与我们的身材非常相似! 要求 与和软件包。 要安装这些软件包,请在R控制台中键入install.packages("tidyverse") 。 请按照安装Circos。 对于当前版本( ),您需要应用我们的以避免文本排列中的无限循环。 或者,您可以下载并使用。 我将尽快报告此问题。 用法 请将circos添加到您的PATH或在fujiplot.R适当设置CIRCOS_PATH 。 Rscript fujiplot.R input_example/input.txt input_example/trait
【文件预览】:
fujiplot-master
----fujiplot.R(10KB)
----output()
--------.gitkeep(0B)
----output_example()
--------circos.png(1.18MB)
--------barplot.pdf(11KB)
--------circos.svg(703KB)
----config()
--------data_tracks.conf(1KB)
--------angle_offset.conf(21B)
--------bands.conf(136B)
--------karyotype.conf(53B)
--------chromosome_order.conf(0B)
--------ideogram_label.conf(179B)
--------chromosome.conf(685B)
--------ideogram.conf(337B)
--------image.conf(525B)
--------ticks.conf(328B)
--------circos.conf(131B)
--------static()
--------main.conf(438B)
----LICENSE(34KB)
----README.md(4KB)
----data_tracks()
--------.gitignore(6B)
----karyotypes()
--------karyotype.human.hg19.txt(39KB)
----input_example()
--------traitlist.txt(2KB)
--------input.txt(72KB)