文件名称：选址的matlab代码-LinkedSelectionMaps:运行链接的选择推断的完整脚本
文件大小：1.11MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-06-17 06:19:11
系统开源
选址的matlab代码链接的选择推论：入门 基本要求 介绍 准备资料 配置文件 基本设置 运行推断 1.基本要求 该程序是用MATLAB编写的，至少需要版本20XX或更高版本才能运行。 此外，（McVicker等，2009）的程序calc_bkgd需要在运行MATLAB代码的系统上进行编译。 该程序是用C语言编写的，具有以下依赖性： gsl-1.16 zlib-1.2.8 glib-2.42.2-也有几个依赖项： pkg-config 利比菲 GNU gettext（） 2.引言 该程序可以推断由于经典扫描（CS）和背景选择（BGS）而导致的链接选择的效果。 CS和BGS的模型在Elyashiv等人（2015年）中有详细介绍。 在“预计算”步骤中，针对一系列选择系数和跨越不同注释，估计了BGS和CS的影响。 此步骤需要大量计算，但是对于给定的选择系数和注释，仅需要一次。 在程序核心的复合似然计算期间，链接选择的这些预先计算的映射图中的每一个均被加载并组合在加权平均值中，加权平均值进行了优化，以使复合似然最大化。 对于CS，BGS和两者的组合效果，当前配置以0-100（其中100 =中性