文件名称：lammps_interface:自动生成LAMMPS输入文件，用于MOF的分子动力学模拟
文件大小：196KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-05-23 15:43:50
Python
LAMMPS接口 作者 彼得·博伊德 *·莫萨维（Mohamad Moosavi） 马修·威特曼 描述 这项计划的目的是为晶体信息文件（之间简单的界面 ）和大型原子分子大规模并行仿真器（ ）。 安装 只需从安装： pip install lammps-interface 出于开发目的，请克隆存储库并从源代码安装它： pip install -e . 注意：在这两种情况下，这都会将lammps-interface添加到您的PATH 。 用法 命令行界面 要查看可选参数类型： lammps-interface --help 要为给定的cif文件类型创建模拟文件，请执行以下操作： lammps-interface cif_file.cif 这将创建带有UFF参数的仿真文件。 Jupyter笔记本 为了将lammps-interface集成到您的项目中，请查看提供的Jupyter
【文件预览】：
lammps_interface-master
----MANIFEST.in(25B)
----.github()
--------workflows()
----notebooks()
--------in.IRMOF-1(532B)
--------data.IRMOF-1(171KB)
--------lammps_interface.ipynb(3KB)
----lammps_interface()
--------uff.py(10KB)
--------MOFFF.py(4KB)
--------BTW.py(15KB)
--------ForceFields.py(183KB)
--------structure_data.py(101KB)
--------lammps_main.py(81KB)
--------dreiding.py(3KB)
--------generic_raspa.py(8KB)
--------lammps_potentials.py(44KB)
--------CIFIO.py(8KB)
--------__init__.py(48B)
--------gas_models.py(274B)
--------user_input.txt(222B)
--------water_models.py(639B)
--------cli.py(1KB)
--------mof_sbus.py(47KB)
--------Molecules.py(18KB)
--------uff_nonbonded.py(10KB)
--------uff4mof.py(18KB)
--------ccdc.py(949B)
--------Dubbeldam.py(4KB)
--------InputHandler.py(18KB)
--------atomic.py(6KB)
----requirements.txt(30B)
----LICENSE(1KB)
----setup.py(1KB)
----README.md(2KB)
----docs()
--------source()
--------Makefile(638B)
--------.gitignore(7B)
----tests()
--------test_cifs.py(595B)
--------cifs()
----.gitignore(278B)
----CHANGELOG.md(2KB)
----.readthedocs.yaml(101B)