picard:Picard工具的练习回购

时间:2024-06-10 02:05:43
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文件名称:picard:Picard工具的练习回购

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更新时间:2024-06-10 02:05:43

Java

一组Java命令行工具,用于处理高通量排序(HTS)数据和格式。 Picard是使用HTSJDK Java库实现的,该库支持访问用于高通量测序数据的常见文件格式,例如和 。 也可以构建一个支持从GA4GH API读取的Picard版本,例如Google Genomics:1.从获取gatk-tools-java库2.Build:ant gatk-tools-java-picard-jar 3.将生成的jar复制到Picard文件夹下的lib / gatk-tools-java /中,例如cp dist / gatk-tools-java-picard-1.0.jar ../picard/lib/ gatk-tools-java / 4.构建Picard:ant -lib lib / ant package-commands-ga4gh 5.您现在可以运行java -jar dist /


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