matlab阻滞增长模型代码-SAGE_II:Commensalibactersp的代谢建模

时间:2024-06-12 20:19:50
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文件名称:matlab阻滞增长模型代码-SAGE_II:Commensalibactersp的代谢建模

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更新时间:2024-06-12 20:19:50

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matlab阻滞增长模型代码Commensalibacter sp。的代谢建模。 测序基因组II 作者:Perrine Steffe,Karim Saied,Boris Schnider 由Noushin Hadadi监督 该项目旨在建立通量平衡模型(FBM),以简化Commensalibacter sp。的简化。 代谢,来自该生物先前鉴定的基因和React。 重建的模型将允许通过使用不同输入代谢物的生长模拟研究Commensalibacter sp。所需的最小葡萄糖和氧气吸收率。 细胞生长。 此目录包含运行Commensalibacter sp的通量平衡分析所需的文件(脚本和模型)。 要执行分析,请确保在UNIX系统上安装了所有依赖项,然后按照“管道”部分中的步骤进行操作。 依存关系 已安装以下软件包的MATLAB R2017b(9.3.0.713579): 眼镜蛇工具箱 乌鸦工具箱 脚本 bios_model.m:脚本,用于定义重氮细菌模型中发现的生物质与生物质构建基块(BBB)的React。 它还包含吸收所需代谢物并填补空白的所有代码,即添加缺少的生物质生产React,从而实现B


【文件预览】:
SAGE_II-master
----biomass_model.m(11KB)
----checkBBBTasks.m(3KB)
----README.md(3KB)

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