文件名称：qeAPI:由Quantum ESPRESSO和Python组成的API
文件大小：3.01MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-05-09 07:49:30
JupyterNotebook
Python-QE API @ run_cases.py更新：已更新run_cases.py用于在配置了slurm系统的HPC服务器上运行多节点作业。 @ 01/21更新：更新了自述文件以阐明在Slurm系统上运行作业的某些方面。 更新@ 12月28日：由于系统环境对campuscluster，改变run_cases.py ， run_cases_bridges2.py和run_cases_phonon.py文件夹中run_cases_script被提交作业SLURM批量系统更新。 @ run_cases.py更新：在run_cases.py添加交互式命令，询问用户是否要更改.pbs文件中的节点号，每个节点的核心号和挂墙时间的.pbs 。 @ 12/15更新：（1）在qe2cif.py中编辑了“ singlePointCalculator”类，使其能够读取总力和单元压力； （2）
【文件预览】：
qeAPI-master
----qe2cif_test.ipynb(16KB)
----periodicTable.json(123KB)
----README.md(16KB)
----run_cases_script()
--------run_cases_expanse.py(6KB)
--------run_cases_phonon.py(4KB)
--------run_cases.py(6KB)
--------run_cases_bridges2.py(6KB)
----raw2qe.py(48KB)
----sssp_precision.json(16KB)
----cubetool.py(18KB)
----test-cif.cif(2KB)
----singlepoint.py(6KB)
----.ipynb_checkpoints()
--------qe2cif_test-checkpoint.ipynb(16KB)
--------phonopy-workflow-checkpoint.ipynb(86KB)
--------qeplot_test-checkpoint.ipynb(483KB)
--------pwPrep_test-checkpoint.ipynb(5KB)
--------qe2DDEC_test-checkpoint.ipynb(25KB)
----qe2cif.py(78KB)
----qeplot.py(19KB)
----example input files()
--------newprefix_pp.in(256B)
--------NaTi2(PO4)3_rlx.in(3KB)
--------newprefix_pp.sbatch(460B)
--------newprefix_nscf.in(3KB)
--------NaTi2(PO4)3_pp.sbatch(464B)
--------NaTi2(PO4)3.cif(2KB)
--------newprefix_dos.sbatch(456B)
--------newprefix_pdos.in(225B)
--------newprefix_scf.sbatch(472B)
--------newprefix_nscf.sbatch(475B)
--------newprefix_scf.in(3KB)
--------NaTi2(PO4)3_rlx.sbatch(476B)
--------newprefix_pdos.sbatch(462B)
--------newprefix_dos.in(221B)
--------NaTi2(PO4)3_pp.in(288B)
----qe2DDEC_test.ipynb(25KB)
----__pycache__()
--------qe2cif.cpython-37.pyc(51KB)
--------raw2qe.cpython-37.pyc(35KB)
--------calculator.cpython-38.pyc(27KB)
--------singlepoint.cpython-37.pyc(6KB)
--------calculator.cpython-37.pyc(27KB)
--------singlepoint.cpython-38.pyc(6KB)
--------qeplot.cpython-37.pyc(13KB)
--------qe2DDEC.cpython-37.pyc(7KB)
--------qe2cif.cpython-38.pyc(51KB)
--------raw2qe.cpython-38.pyc(35KB)
----phonopy-workflow.ipynb(86KB)
----qe2DDEC.py(17KB)
----sssp_efficiency.json(16KB)
----opt_check.py(3KB)
----serialjob(782B)
----images()
--------init-jupyter-2.PNG(9KB)
--------run_cases.PNG(20KB)
--------cif-png.PNG(45KB)
--------nav-pkg-list.png(98KB)
--------distributed-folders.PNG(35KB)
--------nav-pkg-list-options.png(134KB)
--------run_phonon.PNG(27KB)
--------init-jupyter-5.PNG(47KB)
--------pseudo-folder.PNG(40KB)
--------generate-job-control.PNG(14KB)
--------pbs.PNG(13KB)
--------init-jupyter.PNG(31KB)
--------init-jupyter-4.PNG(39KB)
--------nav-defaults.png(457KB)
--------ddec-with-results.PNG(39KB)
--------ddec-without-results.PNG(20KB)
--------incorrect-net-charge.PNG(23KB)
--------init-jupyter-3.PNG(41KB)
----calculator.py(30KB)
----qeplot_test.ipynb(483KB)
----pwPrep_test.ipynb(5KB)
----Notes-on-running-jobs-on-XSEDE-expanse.md(2KB)
----test-output.out(3.08MB)