文件名称：MS2Planner:通过迭代数据采集优化基于串联质谱的代谢组学的研究范围
文件大小：81.62MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-04-08 09:47:05
Python
MS2计划器 输入 它使用从convert_to_table生成的特征表和原始信号.mzTab（曲线模式）作为输入。 输出 它以.txt格式输出最佳路径，path_finder.log是日志文件。 跑 python path_finder.py mode infile outfile intensity_threshold intensity_ratio num_path -infile_raw -intensity_accu -win_len -isolation -restriction -delay -min_scan -max_scan 保留时间的单位是秒（秒），质荷比是道尔顿（Da）。 mode ： apex或baseline或curve apex模式使用顶点文件并应用路径查找算法来查找最佳路径。 baseline模式只是将保留时间分成几个小窗口，窗口的长度由win_len
【文件预览】：
MS2Planner-master
----path_apex.py(8KB)
----path_finder.py(8KB)
----path_curve.py(24KB)
----test()
--------test_data.tar.gz(81.6MB)
----README.md(5KB)
----MS1mzTab.toppas(11KB)
----path_baseline.py(3KB)
----.gitignore(8B)