PredFull:预测完整串联质谱

时间:2024-05-24 09:11:33
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文件名称:PredFull:预测完整串联质谱

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更新时间:2024-05-24 09:11:33

spectrum mass-spectrometry peptides Python

PredFull 访问尝试在线预测 这项工作发表在《分析化学: 刘开元,李素君,王磊,叶玉珍,唐海旭 更新记录 2021.01.01:更新示例结果。 2020.08.22:修复了性能问题。 2020.05.25:支持预测非胰蛋白酶肽。 2019.09.01:第一版。 方法 基于残差卷积网络的结构。 电流精度(料仓大小):0.1 Th。 如何使用 重要笔记 该模型仅支持未修改的肽(至少目前如此) 该模型假设C上为固定的氨基甲酰甲基 输入肽的长度限制为= <30> 2000的峰 预测峰比STRONGEST_PEAK / 1000弱,将被视为噪声,并从输出中将其忽略。 所需的包 建议通过安装依赖项 Tensorflow必须为2.30或更高! Tensorflow在2.3.0之前的版本中存在兼容性错误,无法正确加载模型。 Tensorflow团队解决此问题


【文件预览】:
PredFull-master
----.gitignore(4KB)
----README.md(3KB)
----compare_performance.py(3KB)
----example_prediction.mgf(134B)
----.vscode()
--------settings.json(56B)
----predfull.py(7KB)
----.gitattributes(59B)
----imgs()
--------hcd2.png(62KB)
--------hcd1.png(64KB)
--------model.png(26KB)
----train_model.py(7KB)
----coord_tf.py(14KB)
----pm.h5(74.84MB)
----hcd_testingset.mgf(73.4MB)
----example.tsv(906KB)

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