文件名称：pecheck:检查配对端FASTQ数据完整性
文件大小：77KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-05-17 07:06:42
bioinformatics check integrity pe consistence
pecheck 检查双端FASTQ数据完整性的工具 用法 只需通过-i指定read1文件，并通过-I指定read2文件。 输入文件可以gzip压缩（即R1.fq.gz）。 pecheck -i R1.fq -I R2.fq 然后将生成JSON报告。 如果检查通过，则JSON结果将类似于： { " result " : " passed " , " message " : " " , " read1_num " : 1000 , " read2_num " : 1000 , " read1_bases " : 108040 , " read2_bases " : 109141 } 如果失败，则JSON结果将如下所示： { " result " : " failed " , " message " : " Numbers of read1 and read2 are
【文件预览】：
pecheck-master
----src()
--------zlib()
--------fastqreader.cpp(5KB)
--------sequence.h(363B)
--------read.cpp(7KB)
--------common.h(311B)
--------fastqreader.h(1KB)
--------pecheck.cpp(3KB)
--------sequence.cpp(1KB)
--------unittest.cpp(357B)
--------main.cpp(1KB)
--------options.cpp(735B)
--------options.h(324B)
--------cmdline.h(18KB)
--------util.h(5KB)
--------read.h(1KB)
--------pecheck.h(401B)
--------unittest.h(233B)
----LICENSE(1KB)
----README.md(1KB)
----Makefile(802B)
----.gitignore(288B)