metaPORE:MetaPORE –加州大学旧金山分校Chiu实验室

【文件属性】：
文件名称：metaPORE:MetaPORE –加州大学旧金山分校Chiu实验室
文件大小：122KB
文件格式：ZIP
更新时间：2021-04-27 13:42:26
Shell ### MetaPORE – Chiu实验室### ####加州大学旧金山分校#### 在[this]（ ）手稿中描述了MetaPORE。 该存储库中包含的代码是生物信息学管道MetaPORE，用于分析上述手稿中的Nanopore Minion数据。 此代码已通过Metrichor 2D Basecalling v1.14管道进行了测试，此管道已更新。 在接下来的几周中，我们将使用较新版本的Metrichor测试功能，并提供文档以简化安装过程。 请提出任何问题。

【文件预览】：
metaPORE-master
----metapore_preprocess_ncores.sh(5KB)
----metaporeRT_monitor.sh(6KB)
----taxonomy.sh(1KB)
----create_metaPORE_db.py(2KB)
----metaporeRT_length_exclusion.sh(14KB)
----metaporeRT.sh(15KB)
----split_fasta_by_id.py(2KB)
----metaporeRT_viral.sh(15KB)
----picker.sh(2KB)
----LICENSE(2KB)
----taxonomy_lookup_standalone.pl(5KB)
----README.md(639B)
----populate_database.py(8KB)
----cutadapt_quality.csh(7KB)
----metapore_preprocess.sh(4KB)
----server()
--------start_server(27B)
--------metaporeRT.html(3KB)
--------cgi-bin()
--------js()
--------metaporeRT_v2.html(14KB)
--------server.py(326B)
--------metaporeRT_032715.html(14KB)
--------metaporeRT_dev.html(14KB)