文件名称：seq_crumbs:seq_crumbs 旨在成为小型序列处理实用程序的集合
文件大小：2.15MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-07-29 08:42:00
Python
Seq Crumbs 是小型序列处理实用程序的集合。 Seq Crumbs 模仿 Unix 命令行文本处理实用程序，因此每个实用程序都尝试执行特定任务。 他们中的大多数将一个序列文件作为输入，并创建一个新的处理过的序列文件作为输出。 这种设计鼓励使用 Unix 管道链接多个 Seq Crumbs 实用程序的操作。 您可以在网站中找到有关 seq_crumbs 的更多信息。 可用面包屑 sff_extract 从 454 和 Ion Torrent 使用的文件中提取读数。 split_matepairs 拆分由寡核苷酸序列分隔的配偶对。 filter_by_quality 根据序列的平均质量过滤序列。 filter_duplicates 过滤掉相同的序列。 filter_by_length 根据长度阈值过滤序列。 filter_by_name 使用文件中给定的名称列