文件名称：matlab精度检验代码-BCM3D:BCM3D
文件大小：2GB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-06-10 19:53:16
系统开源
matlab精度检验代码BCM3D 描述 BCM3D是一种图像分析工作流程，将深度学习与数学图像分析相结合，可以准确地对3D荧光图像中生物膜内的单个细菌细胞进行分割和分类。 在BCM3D中，使用具有实验现实SBR，细胞密度，标记方法和细胞形状的模拟生物膜图像训练深层卷积神经网络（CNN）。 此图像分析工作流程的引文： DOI：10.5281 / zenodo.4088658 用法 这是每个模块的简要介绍。 示例和详细信息可以在每个模块中单独找到。 稿件中显示的所有实验数据都可以在“ experimentalData”文件夹中找到。 除非另有说明，否则每个模块的估计运行时间在几分钟之内。 1.模拟3D生物膜图像（一个数据集的预计运行时间约为40分钟） 为了模拟逼真的3D荧光生物膜图像，在这项工作中使用了CellModeller对细菌生物膜内的细胞排列进行建模。 CellModeller是用于大型微生物群落建模的框架。 请参阅的详细说明和安装说明。 3D荧光生物膜图像是通过我们的定制MATLAB代码生成的。 请在“ biofilmSim”文件夹中获取详细的工作流程。 在“ biofilmS