illumina_demux:用于多路复用照明运行的管道

时间:2024-03-24 12:52:10
【文件属性】:

文件名称:illumina_demux:用于多路复用照明运行的管道

文件大小:16KB

文件格式:ZIP

更新时间:2024-03-24 12:52:10

Nextflow

介绍 mpozud00 /解复用是一种生物信息学分析流水线,用于将i5和i7的Illumina数据解复用。 工作流处理来自FastQ输入( , )的原始数据以进行多路分解,有关结果的更多详细信息,请参见。 该管道是使用构建的, 是一种工作流工具,可以以非常便携的方式跨多个计算基础架构运行任务。 它带有docker容器,使安装变得简单,结果可高度重现。 快速开始 一世。 安装 ii。 安装 , 或 iii。 开始运行您自己的分析! 您需要按照“ working_directory / data / fastq / run_id / lane / run_id_lane_read {1,2} .fq.gz”的方式组织fastq文件。 然后从工作目录运行以下指令。 nextflow run mpozud00/demultiplexing -profile < docker/sin


【文件预览】:
illumina_demux-master
----conf()
--------base.config(1KB)
----docker()
--------bcl2fastq()
----Dockerfile(576B)
----nextflow.config(4KB)
----LICENSE(1KB)
----main.nf(12KB)
----environment.yml(321B)
----README.md(2KB)
----docs()
--------usage.md(10KB)
--------README.md(572B)
----bin()
--------scrape_software_versions.py(4KB)

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